Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms