Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRISP1P54107 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms