Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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PGGT1BP53609 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PGGT1BP53609 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PGGT1BP53609 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PGGT1BP53609 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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