Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPFP49454 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPFP49454 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPFP49454 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CENPFP49454 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPFP49454 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPFP49454 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPFP49454 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPFP49454 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPFP49454 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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