Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms