Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP214P35658 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP214P35658 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP214P35658 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP214P35658 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP214P35658 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP214P35658 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP214P35658 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP214P35658 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP214P35658 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms