Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP6P35125 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP6P35125 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP6P35125 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
USP6P35125 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
USP6P35125 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
USP6P35125 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP6P35125 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP6P35125 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP6P35125 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms