Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms