Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA13P31271 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms