Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMBRP28336 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMBRP28336 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMBRP28336 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMBRP28336 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMBRP28336 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMBRP28336 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms