Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA1P21709 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms