Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD247P20963 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD247P20963 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD247P20963 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD247P20963 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD247P20963 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD247P20963 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD247P20963 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD247P20963 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD247P20963 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD247P20963 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD247P20963 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD247P20963 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms