Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA5P20719 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.3 ms