Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB1P18505 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms