Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms