Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms