Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSPP15924 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSPP15924 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSPP15924 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms