Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRF1P14222 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRF1P14222 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRF1P14222 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRF1P14222 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRF1P14222 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRF1P14222 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRF1P14222 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRF1P14222 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRF1P14222 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms