Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC130P13994 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms