Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD8P13378 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD8P13378 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms