Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM10L1P0DMW3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM10L1P0DMW3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms