Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG7O95352 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG7O95352 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG7O95352 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms