Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATE1O95260 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms