Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP2O95045 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP2O95045 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UPP2O95045 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP2O95045 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP2O95045 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP2O95045 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms