Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN7O94888 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms