Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPAG9O60271 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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