Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DENRO43583 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms