Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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