Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODHO43272 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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