Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CEP290O15078 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CEP290O15078 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CEP290O15078 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CEP290O15078 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CEP290O15078 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP290O15078 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP290O15078 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CEP290O15078 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CEP290O15078 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CEP290O15078 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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