Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCTN6O00399 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms