Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms