Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms