Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PCH4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PCH4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PCH4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PCH4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PCH4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PCH4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PCH4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PCH4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PCH4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PCH4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PCH4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PCH4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PCH4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PCH4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms