Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4E171 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4E171 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
B4E171 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4E171 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms