Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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