Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID3CA6NKF2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms