Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms