Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms