Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms