Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms