Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms