Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RARRES3Q9UL19 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms