Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms