Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK10

ZNF225, Zinc finger protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF225Q9UK10 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF225Q9UK10 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms