Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms