Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms