Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms