Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS29Q9UBQ0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms