Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms